أحد نتائج التوسع العثماني في المغرب العربي كان طرد المرابطين من الجزائر. المرابطون كانوا جماعة من الفقهاء والمحاربين المسلمين الذين قاوموا الغزو الإسباني والبرتغالي في المغرب الأقصى. وبعدما توسع العثمانيون في المنطقة، أصبحوا يشتبكون مع المرابطين وأخرجوهم من الجزائر. هذا الصراع أدى في النهاية إلى نهاية حكم المرابطين في المغرب الأقصى وتأثر المنطقة بشكل كبير من تواجد الحكم العثماني فيها.
