الصبغي X يحتوي على عدد أكبر من الجينات والقواعد النيتروجينية من الصبغي Y، وذلك لأن الصبغي X يحتوي على العديد من الجينات المسؤولة عن صفات متنوعة في الجسم، بينما الصبغي Y يحتوي بشكل أساسي على الجينات المسؤولة عن تحديد الجنس.
ويعتقد أن الصبغي X يحوي حوالي 1000 جين إضافي عن الصبغي Y، مما يجعله يحتوي على عدد أكبر من القواعد النيتروجينية. هذا يعني أن الصبغي X يلعب دورا أكبر في تحديد الصفات الوراثية والتطور الجيني للفرد، بينما الصبغي Y يلعب دورا حاسما في تحديد الجنس.