عدد الروابط الببتيدية بين ثلاثة أحماض أمينية هو 2، حيث يحدث تكوين الروابط الببتيدية بين جزيئين من الأحماض الأمينية. يتم تكوين كل رابط ببتيدي من خلال تفاعل بين مجموعة الكربوكسيل (C=O) في الحامض الأميني الأول ومجموعة الأمين (NH2) في الحامض الأميني الثاني. وهكذا لو كانت هناك ثلاثة أحماض أمينية، فإن هناك رابطين ببتيديين سيتم تشكيلهما بين الحمض الأميني الأول والثاني، وبين الثاني والثالث.