غالبًا ما تكون الحروب التي تنشب بين الدول الأعضاء في الاتحاد الكونفدرالي ليست حروب أهلية، بل تكون حروب بين دول ذات سيادة مستقلة. ويكون ذلك نتيجة لنزاعات وصراعات بين الدول الأعضاء في الاتحاد، سواء كانت ناجمة عن خلافات حدودية أو اقتصادية أو سياسية. وعلى الرغم من أنه يمكن حدوث صراعات بين الدول الأعضاء، إلا أن الحرب الناتجة عنها عادة ما تكون بين الجيوش الوطنية للدول وليست حربًا أهلية بين مجموعات داخلية في دولة واحدة.