إن إنتاج الإنزيمات يتم عادةً في خلايا الجسم. تختلف الخلايا في الجسم حسب وظيفتها والأنزيمات التي تحتاجها. على سبيل المثال، الكبد هو جهاز مهم لإنتاج الإنزيمات الهضمية التي تساعد في هضم الطعام. بينما تنتج الخلايا البكتيرية الإنزيمات التي تساعدها في النمو والانتشار. تتم عملية إنتاج الإنزيمات في الخلايا عن طريق الجينات التي تشفر لها. يتم نسخ الجينات وترجمتها لإنتاج البروتينات، بما فيها الإنزيمات.