الأنفصال الكروموسومي الشقيق يحدث في الأنقسام المنصف خلال الانقسام الاختزالي في المرحلة الأولى من التقسيم الخلوي في الدورة الاولى من قسمة الخلايا الجنسية (الميوز). في هذه المرحلة، تنفصل الكروماتيدات الشقيقة اللتان تشكلان كل من الكروموسوم، ثم ينتقلا إلى النهايات المتعاكسة من الخلية الأم.