يعامل الماء المستخدم في غسيل الخضروات بمطهرات مثل محلول الكلور (المبيض) أو الأوزون أو الفينول. هذه المطهرات تستخدم لقتل الجراثيم والميكروبات الموجودة على الخضروات والفواكه، مما يساعد على تقليل خطر الإصابة بالأمراض المعدية المنتقلة عن طريق الطعام. يجب اتباع تعليمات الاستخدام الصحيحة لكل نوع من المطهرات وتقدير الكمية المناسبة التي يجب إضافتها إلى الماء لضمان فعالية العملية وسلامة الخضروات المُعالجة.