الأهداف الخفية لمبدأ ترومان ومشروع مارشال لم تكن واضحة في البداية، ولكن من الممكن تحليلها بعد مرور الوقت ودراسة التأثيرات التي لحقت بهذين الإجراءين. من بين الأهداف الخفية التي قد تكون وراء مبدأ ترومان ومشروع مارشال الاتي:
زيادة النفوذ السياسي والاقتصادي للولايتحدة في أوروبا والعالم، وإضعاف النفوذ السوفياتي ومنع انتشار نموذج الشيوعية في المنطقة.
تعزيز الاقتصاد الأمريكي من خلال توسيع الفرص التجارية والتحالفات الاقتصادية مع دول أوروبا.
دعم الانتعاش الاقتصادي في دول أوروبا الذي تأثر بشدة بعد الحرب العالمية الثانية، والذي كان من الممكن أن يؤثر سلباً على الاقتصاد الأمريكي إذا لم يتم التدخل.
تحقيق الأمان والاستقرار في أوروبا ومنع اندلاع حروب جديدة في المنطقة، وبالتالي حماية مصالح الولايات المتحدة في المنطقة.
هذه بعض الأهداف التي قد تكون واردة كأهداف خفية لمبدأ ترومان ومشروع مارشال، وقد تكون هناك أهداف أخرى لم تُكتشف بعد أو تحتاج إلى دراسة وتحليل عميق لفهمها بشكل أفضل.
