المجهر الإلكتروني هو المجهر الذي يمكنه رؤية أدق التفاصيل داخل الخلايا، بما في ذلك الأعضاء الدقيقة داخل الخلايا مثل الأنسجة والأجهزة. يستخدم المجهر الإلكتروني شعاعاً من الإلكترونات بدلاً من الضوء للتكبير والرؤية. يمكن للمجهر الإلكتروني رؤية أجزاء الخلية بدقة أعلى من المجاهر الضوئية التقليدية، مما يسمح بدراسة تفاصيل هيكلية ووظيفية دقيقة في الخلايا.