من خلال التحلل الذي يحدث بفعل الإنزيمات، يتحول المركب الكبير إلى مركبات أصغر. يبدأ التحلل عادةً بالبيتونات، التي تنقسم إلى ببتيدات وبيدات عديدة، ثم تتحلل هذه المركبات الأصغر إلى أحماض أمينية بسيطة. هذه العملية تعرف باسم هضم البروتين.
هذا النوع من التحلل يُعتبر مقبولًا ومرغوبًا في عملية تحضير الأطعمة، خاصة في حالة تطهير اللحوم أو الأطعمة الأخرى لتحسين جودتها، تذوقها، وقابليتها للهضم والاستفادة منها. قد تستخدم هذه العملية في الصناعة الغذائية لتحسين خواص الأطعمة وزيادة قيمتها الغذائية.